公积金贷款买二套房利率是会增加的，使用住房公积金贷款购买二套房贷款利率将按照基准利率上浮1.1倍执行，如果是贷款五年以上，那就是3.25%的1.1倍，即3.575%，不过也有一部分城市会算作3.58%。相对来说比首套房高了一点，但由于公积金贷款的利率本身不高，实际上还是很划算的，如果有条件的话用公积金贷款买二套房也是不错的选择。
1、利率区别。二套房的贷款利率，是要比首套房的贷款利率高出不少的。如果就公积金贷款而言，二套房贷款的贷款利率，是在首套房的公积金贷款利率的基准础上再上幅10%的。在部分不限购、限贷的城市，如果是首套房，商业贷款首付比例是20%，二套房商业贷款首付款比例为30%。
2、额度区别。二套房的贷款额度，要比首套房的贷款额度低很多的。首套房借款人可贷的额度，最高为购房款的7成，首付为3成，公积金贷款，首付则可低至2成，但是二套房借款人最高仅可贷6成，首付则要4成。具体的贷款额度还有关借款人的资质。
3、贷款的难度区别。二套房贷款的贷款难度，要比首套房贷款的难度高很多，尤其是有遇到资金比较紧张情况的时候，那么二套房的贷款往往是难申请到的。
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